西(🌠)暦2203年、銀河系中(🐌)心部の(🌰)宇宙で大きな(🛍)異変が生(shēng )じ(🍥)た。異次(cì )元断(duàn )(🥈)層から別の銀河が現れ(💤)、核恒星(xīng )系(xì )(👋)付近で(🎏)銀(yín )河系(xì )同士の衝突が起こり(🔸)、多くの星(xīng )々が消滅した(💆)。古代(dài )進(jìn )は宇宙戦艦ヤマトの艦長(zhǎng )として地球(😻)防衛軍の命を受け調(🐖)査に(🔊)向かった。かつての盟(🌚)友デスラー率いるガルマン・ガミラス帝国は壊(🔝)滅的な被害を受けてい(👓)た。
そ(🏉)んな(📳)中、その異次元断層か(🏓)ら恒星間(jiān )空間を回遊する水惑星(🤙)「(💘)アクエリアス」が現(xiàn )(💍)れ、ディ(😯)ン(🆕)ギ(😫)ル星を(🛒)水没させ(😫)る。ヤマトはディンギル(🕶)星から一人(👉)の少年を救っ(🥡)た後地(dì )球(🐔)に向かうが(📻)、デ(⛹)ィンギル帝国の艦(☔)隊の(🐣)攻撃にあい、航行不能(néng )(⏫)となる。しかし、(💼)落下中の衝撃で自動(dòng )操縦シ(🎦)ステムが働き、(🌔)ヤマト(🌛)は(🔉)負(⚡)傷し(😓)た乗組員を乗せたまま地球へ向かう。
地(🎷)球は帰(🐇)還したヤマトの情報から水惑星の存在(😾)を確認(rèn )。接(jiē )(✨)近してくる水(🖐)惑星を(❎)避けるために(🔓)各惑星(🥇)やスペースコロニーへの避難を開(kāi )(😐)始したが、(💝)ディンギ(🍯)ル艦隊の巧みな戦(zhàn )術とハイ(☔)パー放(fàng )(⛄)射ミサイ(🌓)ルの攻(gōng )撃の前(qián )に避難船(chuán )団や地球艦隊は全(quán )(🚠)滅(miè )していき、地球は封鎖されていく。ディンギル(🌼)の長ルガール(👶)神(🛹)官大(📒)総統(➿)は新たな(🎣)移住先(🐞)として地球(qiú )を目(⏬)指していた。そして地(dì )球に移住するためにデ(😧)ィンギル人の取(🆚)った方法と(⛺)は、自らの星(xīng )を水没させ(🤪)た水惑(huò )星「ア(🥛)クエリア(🍕)ス」を人工的にワ(⛑)ープさせることで、同じく地球を水没させて地球人類を絶滅させた(🏋)後(🚿)に移住するというもの。
帰還したヤマトから奇(💈)跡的に救出さ(🕺)れた古代進は(🤟)恋人(🤩)森(sēn )雪(😾)の懸命の看(kàn )護(hù )で一(yī )命を取り(👣)留めたが、自(zì )分の判断ミスにより多くの乗組員(🔣)の命を犠牲にしたと艦(😝)長を辞(🈹)任する(🎖)。その頃、ルガール2世率(📩)いる艦隊は地(❄)球艦隊を撃滅し、一歩(🧡)一(yī )歩地球に向か(🎵)ってい(🤜)た。これに対抗するの(👲)は、も(⭕)はや(📠)ヤマトしか(😼)なかった。古代もヤ(🍖)マトに乗り込もうとするが、自身(shēn )が(🅱)艦長を辞(💙)任したことで躊躇する。し(🍅)かし、ヤマトの(🈴)第(dì )(🏙)一艦(🐪)橋(qiáo )で(🈵)聞いた初代(dài )艦長沖田十三の声(🆓)にヤマトに(🥧)乗り組(zǔ )む決意をす(🤐)る。
ヤマトの船出の日、地(🥜)球防衛軍(jun1 )長(zhǎng )官(guān )より驚愕の発(fā )表がされた。ヤマトの艦長が沖田(🏾)十三(🚯)で(🛰)あることを(👀)。沖(chòng )田(tián )はイ(🗽)スカンダル(😙)へ(🌥)の航海の途中(⛄)、(📈)ヤマ(🖤)トの艦(🛳)医佐(👱)渡酒(jiǔ )造の診断で死亡(🐃)とされたが脳死(🔈)には至って(🐰)お(♊)らず(🐥)、ヤマ(🏞)トのた(🌝)め(🚌)に戻ってきた(🌴)。よみがえった沖田(🌚)のもと、全(🛐)地球の(📃)祈(🚡)りを受(shòu )けヤマトは発(🤞)進した。